Détaché du FBI au Département des Affaires Non-Classées, Fox Mulder enquête sur d’étranges phénomènes : démons, sorciers vaudou, psychokillers, cannibales, extraterrestres, médiums… Persévérant jusqu’à l’acharnement, il poursuit ses investigations avec méthodes et logique.
Mulder n’est pas un illuminé, comme certains veulent le faire croire, il s’est spécialisé dans le paranormal parce qu’il a été le témoin, à l’âge de 12 ans, de l’enlèvement de sa jeune soeur Samantha par des extraterrestres. Depuis cet événement qui a changé le cours de sa vie, il tente avec opiniâtreté de démontrer que les extraterrestres sont bel et bien là et qu’un complot est ourdi dans l’ombre par des membres du gouvernement et de la CIA qui se livrent à des expérimentations sur des êtres vivants au mépris de toute éthique.
Dana Scully a été affectée par ses supérieurs auprès de Mulder pour évaluer le bien-fondé et la pertinence de ces enquêtes, dans le but non-avoué de fermer le Service des Affaires Non-Classées, de discréditer Mulder et de mettre fin à ses recherches qui, en haut lieu, dérangent.
Peu à peu , Scully, docteur en médecine qui examine les faits avec minutie, comprend que la logique scientifique ne peut tout expliquer. A la fin de la première saison, elle a la preuve que Mulder ne fantasme pas et que les extraterrestres existent. Au cours de la deuxième saison, elle est victime d’un enlèvement. Dans la troisième saison, il lui arrive de croire à certains phénomènes alors que Mulder lui même reste sceptique.
Les thèmes abordés – conspiration, paranoïa, horreur et surnaturel et l’excellente qualité des scénarios et de la mise en scène, plaisent. Moins d’un an après sa première diffusion, « X-Files : aux Frontières du Réel » est devenue une série-culte et un vrai phénomène international, réalisant des taux d’audience records dans les nombreux pays où elle est diffusée. Le record d’audience en France est détenu par l’épisode « Le seigneur du Magma » de Rob Bowman, diffusé le 26 octobre 96 sur M6 avec 4,5 millions de téléspectateurs.